菏泽古称曹州，历史悠久，史称“天下之中”，是中国牡丹品种的主要发祥地之一，牡丹栽植始于隋，兴于唐宋，盛于明清，距今已有1400余年的栽培历史，建国后牡丹园经历多次合并、改造，于1982年正式命名为“曹州牡丹园”。通过多次特别是2009年的改造和提升，牡丹园总面积已达到1600亩，是目前国内乃至世界牡丹品种多、栽植面积大、相关科研设施齐备的牡丹主题公园之一。

曹州牡丹园集牡丹、芍药的生产、科研、销售于一体，拥有科研成果近百项；曾代表国家参加法国波尔多国际花卉博览会和‘99昆明世界园艺博览会，并获大奖，被国家指定为“国家牡丹、芍药标准化示范园区”、“863计划---菏泽科研育种基地”；2005年被评为全国农业旅游示范点及山东省农业旅游示范点；2008年曹州牡丹园被山东省旅游局评定为AAA级旅游风景区。2012年8月14日曹州牡丹园被国家旅游局评定为AAAA级旅游风景区。

全园包括五大田牡丹观赏区：主题牡丹观赏区、曹州牡丹古谱区、桑篱园古谱花田区、牡丹芍药科研展示区、获奖牡丹花田和湖山景观区、野趣水景区、世界国花园景区、四季牡丹景区、十二花神景区等十二大景区。

园内景点众多，其中南部的国花馆是牡丹主题博物馆，北部的四季牡丹厅为可四季观赏牡丹的温室。另有国风园、国花门、国花魂、天香阁、桂陵碑、牡丹传奇及各类亭台水榭等景点四十一处。